员工持股平台如何设计？博思诚股权激励咨询机构公司认为非上市公司股权激励一般通过有限合伙企业作为员工持股平台，员工持股平台合伙人在分红时需要交纳相关所得税。自然合伙人取得股息红利所得，根据国家税务总局关于《关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的规定》执行口径的通知（国税函[2001]84号）第二条规定：“合伙企业对外投资分回的利息或者股息、红利，不并入企业的收入，而应单独作为投资者个人取得的利息、股息、红利所得，按“利息、股息、红利所得”应税项目计算缴纳个人所得税。”即按20%计算缴纳个人所得税，从而使员工持股取得股息红利所得的税负由公司制的持股平台40%降低到20%，大大降低了税负。
公司股权结构设计的员工持股平台，法人合伙企业取得股息红利所得，根据《中华人民共和国企业所得税法》第二十六条和《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第八十三条规定，不属于居民企业直接投资于其他居民企业取得的投资收益，不能享受免征企业所得税的优惠政策，应按25%计算缴纳企业所得税。当然，法人合伙人转让限售股，属于应税所得，应按25%计算缴纳企业所得税。公司股权结构设计的自然合伙人取得股权转让所得（包括限售股转让），是按财产转让所得的个税税率计算缴纳个人所得税还是按生产经营所得计算缴纳个人所得税，财政部和国家税务总局并未出台文件予以明确，所以目前全国各省市税务机关对此有不同的地方规定，公司股权结构设计的员工持股平台，在各地对于股权转让征收个税规定有4种情况：
1、股权转让按20%征收
2、分类：有限合伙人和普通合伙人股权转让，税率适用20%；普通合伙人其他营业收入5%-35%征收。
3、分类：有限合伙人和普通合伙人。对自然人普通合伙人，按“个体工商户的生产经营所得”应税项目，适用5%-35%的五级超额累进税率，计算征收个人所得税；对有限合伙人取得的股权投资收益，按“利息、股息、红利所得”应税项目，依20%税率计算缴纳个人所得税。
